Shopify chỉ biết những gì bạn cho nó biết. Hàng trả lại chưa được đặt về kệ, hàng hỏng bị để riêng, lấy nhầm hàng và gõ sai khi nhận hàng đều khiến con số trong trang quản trị lệch khỏi những gì có trên kệ. Khi lệch lên quá cao, bạn bán hàng mình không có; khi lệch xuống quá thấp, sản phẩm hiện hết hàng trong khi vẫn còn trong kho.
Sửa từng sản phẩm trong trang quản trị Shopify thì chậm, còn điền tay tệp CSV tồn kho của Shopify từ phiếu đếm giấy lại mang lỗi gõ phím quay trở lại.
Shopify có thể cập nhật tồn kho từ một lần nhập CSV. Điều còn thiếu là một danh sách gọn gàng gồm mã vạch và số lượng đã đếm mà bạn có thể gộp vào tệp CSV đó.